ゆらゆらと進捗

日々の進捗をメモします。下書きのまま公開することもありますが、その場合「下書き」カテゴリをつけ、後日清書します。

Ⅱ型制限酵素(生命工学)

概要

Ⅱ型制限酵素(生命工学)について概説する。

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内容

intro

ゲノムDNAは巨大分子であり、大腸菌では約4x106塩基対、ヒトでは約3x109塩基対からなっている。
試験管内の組み替え実験で取り扱える大きさは長くてもせいぜい数万塩基対程度であり、それゆえ適当な断片化の手法が必要となる。

超音波のような物理的手段や科学的手段によっても断片化できるが、ここでは酵素による特異的な分解について簡潔にまとめる。

酵素の表記について

たとえばEcoRIでは、大腸菌Escherichia coli RY13株からI番目に単離されたという意味。

Alu I

  • 由来微生物
    • Arthrobacter luteus
  • 認識配列
    • 5' AG|CT 3'
      3' TC|GA 5'
    • 平滑末端

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Hae II

  • 由来微生物
    • Haemophilus aegyptius
  • 認識配列
    • 5' GG|CC 3'
      3' CC|GG 5'
    • 平滑末端

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Sma I

  • 由来微生物
    • Serratia marcescens Sb
  • 認識配列
    • 5'CCC|GGG 3'
      3' GGG|CCC 5'
    • 平滑末端

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Taq I

  • 由来微生物
    • Thermus aquaticus YTI
  • 認識配列
    • 5' T|CGA 3'
      3' AGC|T 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Bam HI

  • 由来微生物
    • Bacillus amyloliquefaciens H
  • 認識配列
    • 5' G|GATCC 3'
      3' CCTAG|G 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Bgl II

  • 由来微生物
    • Bacillus globigii
  • 認識配列
    • 5' A|GATCT 3'
      3' TCTAG|A 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Eco RI

  • 由来微生物
    • Escherichia coli RY13
  • 認識配列
    • 5' G|AATTC 3'
      3' CTTAA|G 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Hin dIII

  • 由来微生物
    • Haemophilus influenzae Rd
  • 認識配列
    • 5' A|AGCTT 3'
      3' TTCGA|A 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Sal I

  • 由来微生物
    • Streptomyces albus G
  • 認識配列
    • 5' G|TCGAC 3'
      3' CAGCT|G 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Xba I

  • 由来微生物
    • Xanthomonas badrii
  • 認識配列
    • 5' T|CTAGA 3'
      3' AGATC|T 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Xho I

  • 由来微生物
    • Xanthomonas holcicola
  • 認識配列
    • 5' C|TCGAG 3'
      3' GAGCT|C 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Not I

  • 由来微生物
    • Nocardia otitidis
  • 認識配列
    • 5' GC|GGCCGC 3'
      3' CGCCGG|CG 5'
    • 付着末端(5'側突出)

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Pst I

  • 由来微生物
    • Providencia stuartii 164
  • 認識配列
    • 5' CTGCA|G 3'
      3' G|ACGTC 5'
    • 付着末端(3'側突出)

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